受託解析お年玉キャンペーン
シーケンスに加えて、論文作成には欠かせないデータ解析・作図まで込みのスペシャルプラン
キャンペーン期間：2022年2月28日お問い合わせまで
PacBio Hifi ロングリードシーケンス受託解析
- PacBio Hifi ロングリードシーケンス
- HiFiライブラリ調整、Sequel Ⅱ CCS Sequencing、ヒト用データ解析（SV,CNV）
- バイオインフォマティクス
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- Circos plot
- 20サンプル以上の場合、パスウェイエンリッチメント解析
Aコース：トリオのタンデムリピートの探索
- PacBio Hifi ロングリードシーケンス
- HiFiライブラリ調整、Sequel Ⅱ CCS Sequencing、ヒト用データ解析（SV,CNV）
- バイオインフォマティクス
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- タンデムリピートの検出
- 遺伝子アノテーション
- トリオのタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索
Bコース：疾患群共通のタンデムリピートの探索
- PacBio Hifi ロングリードシーケンス
- HiFiライブラリ調整、Sequel Ⅱ CCS Sequencing、ヒト用データ解析（SV,CNV）
- バイオインフォマティクス
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- タンデムリピートの検出
- 遺伝子アノテーション
- 疾患群のタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索
臨床研究向け発現解析の決定版
- RNAシーケンス
- ライブラリ調整、NovaSeq6000による（PolyA 4Gb/13.3Mぺアードリード）によるシーケンシング
- バイオインフォマティクス
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- 発現定量解析：マッピング、 発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、20サンプル以上の場合は主成分分析
- 二群間解析における発現量比較解析：二群間解析（Volcano plot、４組組み合わせまで）、クラスタリング、ヒートマップ、 主成分分析
- 発現変動遺伝子の抽出
- 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化（Box plotなど）
- GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析、20サンプル以上の場合はWGCNA（重み付け遺伝子共発現ネットワーク解析）
Aコース：発現変動遺伝子の群間解析
- シングルセルRNA-seq
- 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調整、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
- バイオインフォマティクス
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討
- GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析
Bコース：細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析
- シングルセルRNA-seq
- 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調整、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
- バイオインフォマティクス
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- 疑似系譜解析（Cell trajectoryの推定、マーカー遺伝子の検討）
- 遺伝子アノテーション
- GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析
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